2020年12月24日木曜日

自炊

午前
・標本整理

午後
・会議
・自炊PDF化
・データ整理

PDFの自炊をすると年末を感じる

2020年12月23日水曜日

マンツーマン

午前
・標本整理

午後
・授業
・資料作成

マンツーマン授業。教える学生の数が少ないほど、授業内容は濃くなる。

2020年12月22日火曜日

不意に

午前
・資料作成
・会議

午後
・個人ゼミ
・データ解析

不意に時間ができた。何をして良いか分からなくなってしまった。

8月に実験をして放置していたDNAデータの整理に手をだす。とある種の成績が悪い。

2020年12月21日月曜日

バタバタ

午前
・標本整理

午後
・DNAシーケンス準備
・個人ゼミ
・資料作成

今年最後のDNAシーケンス。5プレート分を発注。

放置していた明日の会議の準備でバタバタした。

2020年12月18日金曜日

マンツーマン

午前
・授業

午後
・個人ゼミ
・論文書き
・データ整理

昨日、再投稿した論文が、いきなり指摘を受けて返却。早速、修正をして再投稿。

久しぶりの授業は、マンツーマン。

2020年12月17日木曜日

統計ゼミ

午前
・論文書き
・統計ゼミ

午後
・生態ゼミ
・統計ゼミ
・論文書き

論文の再投稿!

ゼミだらけの木曜日。ひとまず、今年は終了。

ここ数年、統計ゼミと称して、Rの使い方&統計解析の勉強をしている。教える方も、教わる方も、Rも数学も得意ではないレベルの人が使用した本の感想。

昨年、使った本。評判が良かったので使った。


Rによるやさしい統計学

Rの使い方、統計のレベル、ともに初学者向け。とくに、統計に関しては、数式の説明が最低限なので、数式アレルギーでもどうにか読むことができるかと。

初めて勉強にするのにオススメの1冊。

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昨年、上記の本を勉強した学生が、今年使った本。まだ半分ぐらいしか読んでいない段階での感想。


Rをはじめよう生命科学のためのRStudio入門

RStudioとなっているが、RStudioならでの機能はそれほどないので、Rで使用しても大きな問題はない。

統計モデリングの考え方、および、dplryとggplot2を使ったデータトリミングと作図を解説している。

dplryとggplot2の勉強を始めた人には超オススメ!

統計モデリングの考え方も、作図の重要性が強調されていたりと、とても参考になる!

ただし、統計の数学的な記述はほとんどないので、全く統計の知識がないまま読むと、むしろ理解できないかも。統計の勉強は別でやってね、と本にも書いてある。

現在のところ、「Rによるやさしい統計学」⇨「Rをはじめよう生命科学のためのRStudio入門」、が良い気がする。

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今年の3年生が使った本。上記と同様に半分読んだ感想。


データサイエンスの基礎 Rによる統計学独習

「Rによるやさしい統計学」に比べると、数学的な説明が詳しい。

Rも統計も苦手な人が手を出すと挫折するかも。

データサイエンスについて、キチンと勉強したい人向けかも。

2020年12月16日水曜日

駐車場

午前
・DNA抽出
・個人ゼミ

午後
・卒論手伝い(形態観察)
・個人ゼミ
・卒論手伝い(形態観察)
・論文書き

実験する時間が取れないので早朝にきたら、積雪で駐車場の区画が分からない。


明日まで続くようだ。

2020年12月14日月曜日

午前
・シーケンス準備
・資料作成

午後
・会議
・標本整理
・会議
・論文書き

寒くなってきた。まだ、雨だけど、明日には今年初めての雪になりそう。

Pit fallで採集したカニ。種は調べていない。

2020年12月10日木曜日

曲線の長さの測り方

午前
・卒論手伝い(PCR実験)
・統計ゼミ

午後
・生態ゼミ
・統計ゼミ
・卒論手伝い(電気泳動)
・標本整理

簡単な曲線の長さの測り方を探すが見つからない。inkscapeやgimpでもいけるらしいが、どうもうまいくない。

2020年12月9日水曜日

プロテナーゼK

午前
・資料作成
・授業準備(相談)

午後
・DNA抽出
・資料作成
・会議
・PCR実験

体を半分に割って、そのままプロテナーゼK処理を行なったら、外骨格と胃内容物のみが残った。

2020年12月8日火曜日

無理やり

午前
・DNA抽出

午後
・標本整理
・会議
・書類作成

期限が迫っている自分の実験を無理やりやったら、予定がおかしくなった、、、。

この状況はいつ改善されるのか。

2020年12月4日金曜日

顕微鏡

午前
・標本整理

午後
・標本整理

ところどころ学生に標本の扱い方や実験の仕方の説明もした。

久しぶりに顕微鏡を覗いた。

2020年12月3日木曜日

記憶

午前
・書類作成
・統計ゼミ

午後
・生態ゼミ
・統計ゼミ
・覚えていない、、、メール返信

ずっと、学生と話をしていた気がするけど、途中からの記憶がない。

最後の方は、無意識でメールを書いてた。

2020年12月2日水曜日

午前
・会議
・卒論手伝い(研究計画)

午後
・個人ゼミ
・卒論手伝い(実験指導)
・論文書き

卒業研究。この時期に急転直下で、、、。