出遅れ気味に大学にきて、シークエンスチェック。その後、簡単に系統樹を描いてみる。困ったことを発見。すぐに再実験をしたいところだが、昨日の時点で予算を使い切ったことが判明しているので、どうしようもない。放置しておくと忘れそうなのでメモ。
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| 左が16S、右がCOI |
基本的にはCOIと１６Sで各クレード含まれるサンプルは一致しているけど、COIの右下のクレードがおかしい。１６Sでは３つのクレードに含まれるサンプルが１つのクレードを形成している。形態を考慮にいれると１６Sの系統樹が正しいと考えられるので、多分、偽遺伝子を読んだのだろう。今回は２つの領域を読んでいたので気づいたが、１領域しか読んでいなかったら間違った考察をしていたかも。サソリモドキはCOIのみなので、ちょっと怖くなってきた。
ミトコンが終わったら核も解析したいが、当分無理そう、、、。
ただ、１６Sの結果が正しいとすると、なかなか面白い結果になっている。（連休明けに届くと思われる科研費の結果次第だけど）再実験は当分できそうにないので、学会では、怪しいデータを除いて発表することになりそう。
DNA-82-91、DNA-106・7・9・11がおかしい。プライマーを変えて実験？
