・論文書き
・データ解析
午後
・データ解析
・卒論手伝い
・データ解析
3月に修了した学生の修論一部、および、伊豆諸島ネタ論文を英文校閲へ。両方とも今月中には投稿できるか。
今月末の学会準備に関連して、(mac)ターミナルを使ったファイルを検索して移動する方法を勉強した。
塩基配列データはこんな感じで、サンプルIDと遺伝子領域、をファイル名にしている。
ここから、「COI」データを取り出したいときは、ターミナル(mac)で下記を実行すれば良い。
$ find ./AAA -type f -name "*COI*" -print | xargs -J% cp % ./BBB「./AAA」は塩基配列データのあるフォルダを示しており、この場合、カレントディレクトリに「AAA」フォルダに配列データがある場合を想定。
「./BBB」は移動したいフォルダで、この場合、カレントディレクトリに「BBB」フォルダに配列データがある場合を想定。
「cp」はコピーで、移動したい場合には「mv」とすれば良い。
これまではポチポチ、コピペをしていたので、それと比べると成長した感じがする。