2022年9月16日金曜日

分化

午前
・野外調査

午後
・標本整理
・データ整理

シーケンス結果が返ってきた。小笠原と琉球のサンプルが予想外の結果だった。持ち込みだと思っていたのだが、分化していた!

2022年9月15日木曜日

ヘッドセット

午前
・標本整理

午後
・資料作成
・標本整理

ヘッドセットを使用すると、ビデオ通話やネット動画止まるようになった。

外すと動くのでPC本体の故障ではなくヘッドセットの影響と思われる。USBで繋ぐとビデオがおかしくなる、とういうのも少し考えにくい気もするが。

授業は対面になったが、オンライン会議は引き続き行われるので、新しい購入せざるをえない。

2022年9月14日水曜日

annotation_map_tile( )

午前
・卒論手伝い(野外調査)

午後
・資料作成

学生用の作図コマンド作成で、OpenSteetMapから国土地理院タイルに変更するのに思いっきりハマってしまった。
国土地理院タイルの全国最新写真(シームレス)を「annotation_map_tile()」で使う場合、「/{z}/{x}/{y}」を「/${z}/${x}/${y}」にする必要がある。
ggplot() +
  annotation_map_tile(zoomin = -1,
  type="https://cyberjapandata.gsi.go.jp/xyz/seamlessphoto/${z}/${x}/${y}.jpg")
エラーでずっと指摘されていたのが、意味が分からなかったのが、そのままだった。

2022年9月13日火曜日

放置

午前
・PCR
・授業参観

午後
・電気泳動
・シーケンス準備
・資料作成

昨日失敗したサンプルを再PCR。全て成功だった。
PCR前に4時間95℃で放置したらダメになる、ということが証明された。

2022年9月12日月曜日

CleanMyMac

午前
・DNA抽出
・PCR

午後
・会議×3
・電気泳動
・資料作成

ホットスタートPCRをやろうとして、最初の熱変性でHOLDして解除するのを忘れていた。4時間以上95℃で放置してしまった。電気泳動してみたが全滅だった。
できるだけ軽量のまま使用してきたMac Book Airの立ち上がりが結構遅くなってきた。

評判の良さそうな、CleanMyMac、を購入してみた。

林檎マークが消えるまでの時間は、あまり変わらない気がするが、消えてから使用できるまでの時間は短縮された、、、気がする。

クリーンアップ、セキュリティー、高速の3つを対処してくれる。imacでウイルスが発見された、、、広告が出て誘導されるものらしい。
こんな感じで不要なものを教えてくれる。
アプリを削除したのちに、残ったファイルなど関連ファイルを探して教えてくれるのは、とても良い気がする。高速化にどれほど効果的なのか分からないけど。

スペースレンジという、フォルダ、ファイルを視覚化する機能が、全てのファイルやフォルダを整理して表示されているだけだと気付かず、表示されたファイルが不要なファイルと勘違いして、必要なappを削除してしまった。その再インストールや設定に時間を取られた。

Zoteroを削除したときには焦った。ソフトを再インストールして同期で無事に対応できた。

どれぐらい早くなっているのかキチンと計測はしていないが、整理をして爽快な気持ちにはなれる!上記のように、間違って必要なものも消してしまう可能性があるので、冷静な判断が必要。

このappを作成している会社はウクライナのキエフにある(ウクライナへの寄付も募っている)。 データはAmazon Web Services、支払いシステムはUKにあるから心配しないで!とのこと。

2022年9月9日金曜日

次は

午前
・資料作成
・会議

午後
・データ整理

シーケンス結果が戻ってきたので、少し解析。

ダンゴムシ型は何となく先が見えてきた。次は、ワラジムシ型。こちらは、そもそも科が良く分からないものも多い。

地道に進めるかしかない。

2022年9月8日木曜日

集中

午前
・標本整理

午後
・標本整理
・データ整理

昨日に引き続き、集中できた一日になった。