午前
・データ解析
・生態学ゼミ(中間発表)
午後
・データ解析
ML法の系統樹作成にこれまでは、RAxMLを使っていたが、IQ-TREEだとモデル選択を一緒にやってくれて、しかも速い(速度が気になるほどでのデータではないが)、ということで試してみることにした。
ネット情報を参考にしてやったら大きな混乱もなくできた。
パーティション用のnexusファイルの設定が間違っていることにずっと気づかず、BEASTを実行しようとしてoverlapの警告で判明した。今後はこちらがメインになりそう。