土と生き物
土の中の生き物を地道に紹介します。
2021年1月14日木曜日
GMYC
午前
・標本整理
午後
・データ解析
・会議
原稿用解析。最終氷期の生息適地モデルと並んでやってみたかったGMYC(Generalized Mixed Yule Coalescent)をやってみた。
BEASTを使って分岐年代付き系統樹を作成し、Rのlibrary(splits)を実行すればできる。色々と新しい方法も開発されているようなので、もう少し勉強が必要。
赤で示されたクレードは、系統関係からは同種と判断するのが妥当と思われる。
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