午前
・標本整理
午後
・データ解析
・論文書き(マダニ卒論論文化)
今日はマダニ卒論の論文化を頑張るつもりだったのだが、最近、開始した共同研究のデータ解析について相談があり、それに時間がかかってしまった。まだ、回答できていないが。
論文化は、文章書きをやるつもりだったが、調子が狂ったという言い訳で作図に手を出してしまった。
leafletでは、leaflet.extrasパッケージのaddHeatmap() を使うと、ヒートマップを簡単に作ることができる。
密度を色で表現していることは良く分かるのだが、その原理がよく分からない。
で、同じような?方法として、むしろ一般的なのはカーネル密度推定。RでもGISにカーネル密度推定を利用する方法は色々とあるみたいなのだが、leafletに掲載する方法はあまり見当たらない。
非常に分かりやすいサイトを発見したので、早速試してみた。図は作れたが、、、詳細を理解できない。
予想よりも密度が非常に低いのだが、これはグリッドサイズの問題?地点数が少ないから?