ggtree

午前
・標本整理

午後
・データ解析

系統樹の描画はこれまで、FigTree ＋ お絵かきソフト、を使っていた。

お絵かきソフトを使うと細かな描画が楽だけど、一斉に指定できないなどの不便がある。

何か良い方法がないかと探していたら、Rのggtreeパッケージを発見した。

ggtreeを使ってRで系統樹を扱う

ggtree: Elegant Graphics for Phylogenetic Tree Visualization and Annotation

Phylogenetic trees in R using ggtree

描画すること自体は簡単。

ただ、OTU名を変更してグループ化したら動かない、、、もう少し勉強が必要。