2020年3月17日火曜日

カーネル密度推定

午前
・標本整理

午後
・データ解析
・論文書き(マダニ卒論論文化)

今日はマダニ卒論の論文化を頑張るつもりだったのだが、最近、開始した共同研究のデータ解析について相談があり、それに時間がかかってしまった。まだ、回答できていないが。

論文化は、文章書きをやるつもりだったが、調子が狂ったという言い訳で作図に手を出してしまった。

leafletでは、leaflet.extrasパッケージのaddHeatmap() を使うと、ヒートマップを簡単に作ることができる。


密度を色で表現していることは良く分かるのだが、その原理がよく分からない。

で、同じような?方法として、むしろ一般的なのはカーネル密度推定。RでもGISにカーネル密度推定を利用する方法は色々とあるみたいなのだが、leafletに掲載する方法はあまり見当たらない。

非常に分かりやすいサイトを発見したので、早速試してみた。図は作れたが、、、詳細を理解できない。

予想よりも密度が非常に低いのだが、これはグリッドサイズの問題?地点数が少ないから?