2018年12月28日金曜日

Major

午前
・電気泳動
・シーケンス結果整理

午後
・シーケンス結果整理
・自炊PDF化

昨夜、4月に投稿した論文の回答がきた。メールの文面ではMajorと書かれていたので、本日、気重な気分でサイトを確認したら、本質的については大きな指摘はなく、英語がひどい、のが大きな問題だった。

査読者の2名とも、違うネイティブにチェックしてもらえ、と指摘された。

今年最後?のPCR実験で、どうにか先が見えた、、、気がする。年明け早々にシーケンスに出して安心したい。

シーケンス結果整理は終わりそうにない。

年末恒例になってきた文献のPDF化も進める。

時折、雪が降っているが、平地では積もるほどではない。

2018年12月27日木曜日

コンタミ

午前
・シーケンス結果整理
・PCR実験

午後
・電気泳動
・PCR実験
・シーケンス結果整理

卒論を兼ねて2ヶ月間で10plate分のシーケンスを行なった。その整理を進めるが、面白い結果だと思っていたサンプルが、コンタミが疑わしくなってきた。

焦って実験してもミスをしそうだな、と思いつつも、気になって仕方がないので、nestedPCRを行なってみる。

2018年12月26日水曜日

Lehtomäki et al. (2018) Diversity and Distributions

午前
・シーケンス結果整理

午後
・標本整理
・シーケンス結果整理

琉球大学の久保田先生グループの論文。

Spatial conservation prioritization for the East Asian islands: A balanced representation of multitaxon biogeography in a protected area network
Lehtomäki et al. (2018) Diversity and Distributions, 2, 18–137

愛知目標では2020年までに陸地の17%を保護区とすることが求められているが、どのような基準で保護区を作成するのが良いのかは難しい問題である。

そこで、日本産脊椎動物(哺乳類、鳥類、両生類、爬虫類、淡水魚)、および、維管束植物の全種を対象に生態ニッチモデルを作成し、その多様性を効果的に保護する保護区について検討している。

ニッチモデリングに際しては、現在・最終氷河期の気温・降水量に加えて、地質の安定性の指標として沖積平野(河川の堆積物でできた平野)や火砕流(火山に由来する物質)、生物の移動の指標して大陸からの距離なども含めている。

多様性と環境要因の関係は、random‐forest regression analyses、で解析している。初めて知った方法だが、randomForestというRパッケージがある。

ちなみに、解析に用いたデータは、6325種、4,389,4894地点のデータ。

2018年12月25日火曜日

GIMPの新しいヴァージョン2.10

午前
・系統解析

午後
・SEM撮影
・卒論指導
・シーケンス結果整理

お金を払ってPhotoshopを使いたくない人には必須?のフリーの画像編集ソフトGIMPの新しいヴァージョン2.10がリリースされていた。

何が新しくなったのか不明だが、悪い評判は無いようなのでインストール。見た目が結構違う。

最新の2.10のデフォルト。


これまで使っていた2.8。


そのうち慣れるのだろうけど、と思い、しばらく使っていたが、、、使いづらい。

「GIMP-2.10」⇒「設定」⇒「ユーザーインターフェイス」で、「テーマ」と「Icon Thema」を変更することで、見た目を変更できる。

「テーマ」を「System」、「Icon Thema」を「Legacy」にすると、2.8と同じっぽく見える?


アイコンが少し凛々しくなったきがする。左が2.8で右が2.10。

2018年12月21日金曜日

飛び飛び

午前
・電気泳動
・PCR実験

午後
・ゼミ
・電気泳動
・PCR実験
・書類書き
・シーケンス結果整理

今年中にあと1plate分はシーケンスに出したい。しかし、PCRがナカナカ上手くいかない。見事に飛び飛びに増えるサンプルとか、、、。

2018年12月20日木曜日

忘れか?

午前
・シーケンス
・PCR実験

午後
・電気泳動
・会議
・PCR実験
・書類書き

卒論データを見ていたら実験をやりたくなってしまい、急遽実験、、、欲張ってバタバタしながら実験をしたらミスしまくった。

確実に増えるはずのサンプルが、、、taq忘れか?

2018年12月19日水曜日

午前
・卒論兼野外調査

午後 ・卒論兼野外調査
・PCR産物精製

卒論を兼ねて新しい研究を開始。中腰の時間が長いのが辛い。

本学で牛が飼われていることを、先日、初めて知った。

2018年12月18日火曜日

ミス

午前
・授業
・卒論指導

午後
・卒論指導
・標本整理
・DNA抽出

卒論に使った標本を整理していたら、古い標本に大きな種同定ミスがあることを発見。この整理にかなりの時間を要した。

明日は、新卒論を兼ねて新しい調査を行う。天気予報は良さそうだけど。

2018年12月17日月曜日

目白押し

午前
・DNA抽出
・ゼミ

午後
・会議
・授業準備
・シーケンス結果整理

焦って印刷したら、大量に間違って印刷してしまった。

ラクビー全日本選手権・大学選手権、甲子園ボール、と大きな大会が目白押しな土日だった、、、どれも観れなかった。

朝日杯は、武豊の初制覇+STOP外国人ジョッキー、に期待したけどダメだった。今週も外国人ジョッキーが勝ちそうだし。

2018年12月14日金曜日

一安心

午前
・標本整理

午後
・ゼミ
・卒論指導
・DNA抽出

卒業研究に使用するために古い標本を整理していたら、色々と気なる標本を発見し、思わずDNA抽出にはまってしまった。

やっとスタッドレスに替え一安心。先週末の雪予報が不安だった。

2018年12月13日木曜日

断片化

午前
・PCR実験
・シーケンス結果整理

午後
・電気泳動
・会議
・シーケンス結果整理

抽出後、冷蔵庫で約10?年保管されていたDNAでPCRをしてみたが、バンドがたくさん。断片化か?

2018年12月12日水曜日

一致しない

午前
・学外会議

午後
・卒論指導

某所で採集されたLigidium。記載種とは一致しないッポい。この仲間は変異が大きいことが指摘されていたが、やはり、大変みたい。

2018年12月11日火曜日

Creeper

午前
・授業
・シーケンス
・SEM準備

午後
・SEM撮影
・PCR実験

久しぶりにSEM撮影をした。厳密にはSEMではないが。いまいち綺麗に撮影できない。

Haplophthalmus danicus。外来種。


背面に突起構造があるのが特徴。このような形態を持つ種をCreeperと呼ぶ。

基本的に小型種で、地中や洞窟などに多い。

突起構造は、水にトッラプされるのを防ぐためと考えられている。体が小さいので、水滴があると表面張力でトラップされてしまうのだろう。

参考
Eco-morphological strategies in terrestrial isopods
Schmalfuss (1984) Symp zool Soc Lond, 53: 49–63

2018年12月10日月曜日

延長戦

午前
・PCR実験
・ゼミ

午後
・文献整理
・授業準備
・SEM準備

放置しまくった標本を決着すべく、久しぶりにSEM撮影の準備を進めた。


ラクビーで引き分けといえば抽選だと思っていたが、日本選手権のサントリーVSヤマハは延長戦をやっていた。

10分間の延長戦でも決着がつかないと、サッカーのPK戦のようにゴールキック対決とのこと。

2018年12月7日金曜日

雪予報

午前
・シーケンス結果整理

午後
・ゼミ
・DNA抽出
・データ整理

シーケンスの成功率が高くて安心した。

簡易の系統樹を作成してみるが、結果は良さそう。


土日は雪予報。今週は積もらないで欲しい。

2018年12月6日木曜日

どツボ

午前
・何をしたのか覚えていない

午後
・会議
・論文化(修論)

(学生の)修論データの論文化に向けて再解析を進めるが、完全にどツボにハマってしまった。どうにか解決策を見つけたッポイがかなり不安なので、相談メールを出して終了。

疲れた。

2018年12月5日水曜日

無駄のない時間

午前
・電気泳動
・PCR産物の精製

午後
・シーケンス
・学外で研究相談
・文献整理

タイトなスケジュールの一日。ほとんど無駄のない時間を過ごした。毎日こうなら、もっと効率的なのだろうが。

2018年12月4日火曜日

The Symposium on the Biology of Terrestrial Isopods

午前
・シーケンス結果整理
・卒論指導

午後
・シーケンス結果整理
・標本整理
・PCR実験
・データ整理

初めの次世代シーケンサー、、、不発。そう簡単にはいかないか。

応募しようとしていた助成金、、、今年は新規応募なしになった。

The Symposium on the Biology of Terrestrial Isopods(国際陸生等脚類会議)の特集記事がZookeysで公開された。

いわゆるプロシーディングとは若干異なり、会議に参加していない人も投稿している、、、私がそう。

Local and landscape effects on species compositions of terrestrial isopods in public parks of a commuter town in Japan
Nasu, Kitagawa, Karasawa (2018) ZooKeys, 801: 389–399

内容はこちら

2018年12月3日月曜日

興奮

午前
・PCR実験
・ゼミ

午後
・成績付け
・卒論指導
・成績付け

苦戦が続いたある分類群だが、良いプライマーが見つかった。今年中は、共同研究者に結果を送れそうで一安心。

早明戦は、早稲田大が勝利。

明治大が帝京大戦とは違って、攻撃がイマイチだなと思って観ていたけど、これが「防御を鍛えてきた」という早稲田大の強さなんだなと、試合後に思った。

1トライ差まで詰め寄って、最後の明治大の攻撃と早稲田大の防御の攻防は、とても興奮した!

2018年11月30日金曜日

QuickMapServices

午前
・小学生訪問
・PCR産物精製

午後
・ゼミ
・シーケンス結果の整理
・シーケンス

QGIS3では、「OpenLayers plugin」が使えなくなった(?)。

「QuickMapServices」が、その代わりになるみたい。

1)「プラグインの管理とインストール」で「QuickMapServices」をインストールする。

2)「Web」に「QuickMapServices」が出現するので、カーソルを合わせて、下の方の「Settings」をクリックする。

3)「More servises」にして、「Get contributed pack」をクリックする。

4)「Web」の「QuickMapServices」を開くと、色々な地図が使えるようになる。

2018年11月29日木曜日

QGIS3.4.2

午前
・学会発表の準備
・卒論指導

午後
・会議
・学会発表の準備

明日は小学1年生とお話し。サソリモドキがどうにか生存してくれた。喜んでくれれば良いけど。

QGIS3.4.2がリリースされていた。

インストールにはPython3.6が必要。3.7ではダメ。

まだ、ほとんど使っていないが、微妙に違うところがある。

2018年11月28日水曜日

思ってはいる

午前
・シーケンス結果の整理

午後
・学外会議
・シーケンス準備
・学会発表の準備

土曜日の発表の準備をいい加減進める、、、9月の昆虫学会の発表にデータて再解析。


発表が終わったら投稿しなければ、、、と思ってはいるのだが。

2018年11月27日火曜日

ミツバチの世界へ旅する

午前
・電気泳動
・卒論指導兼PCR実験

午後
・授業準備
・卒論指導兼電気泳動
・授業
・PCR産物の精製

先日、福岡にいく車内で読んだ。


ミツバチの世界へ旅する

ミツバチは養蜂や社会性など興味深い点が多く、古くから研究が行われているのに、まだまだ面白い発見あるのだと痛感させられる。

まず最初の発見は、個体認識能力の変化である。社会性昆虫にとって重要なことの一つに、コロニーを構成する個体の認識がある。この能力がないと、血縁がなくロクに働かないニートに住み着かれてしまう可能性があるのだ。

したがって、個体認識能力は普遍である考えられるが、実は、結構簡単に変わってしまうことを筆者は発見した。しかし、なぜ簡単に変えてしまうのか、その理由までは解明できていないそうだ。

次に、女王通しの殺し合いである。

ミツバチは、巣が巨大になると二つに別れる。この際、一方には前の女王、もう一方は新女王が引き継ぐことになる。しかし、巣の中で複数の女王が育てられるので、これら女王間で、新女王の座を巡って激しい戦いが起こっているのである。

実際には、成虫同士がバタバタ戦うのでなく、幼虫が育つ王台という場所を壊してしまうことで排除している。

最初に羽化した女王が王台を壊すのだが、この時、もう時期羽化しそうな王台を認識し、それを狙って壊すことができるらしい。

個人的に最も驚いたのが、出巣時に持ち出す餌の量だ。働きバチは、蜜や花粉を探しに巣を飛び出すが、この時に自分の栄養も持って出て行く。このとき、多くの栄養を持って行けば良いような気もするが、そうすると体重が重く燃費が悪くなる。したがって、目的地に対応して栄養の量をきちんと調節しているそうだ。

しかも、単純に量だけでなく、糖分の濃度まで評価できるそうだ。

他に脳内分泌物質の研究や、ポスドク時代のバッタやケブカアカチャコガネの話、そして、青年海外協力隊として赴任したフィリピンでの話など、話題がとても多い。シリーズ最厚かも。

著者は、進学や就職に際して、色々と悩みながら進んできたそうだ。思い通りに進めなかった経験を経て、著者は「自分が望むことをぼんやりとしか知覚できないのでは」という思いに辿りついた。
「心の中に、やりたいことがあっても、それを正確な形で思い描くことができない」と言い換えることもできる。

そして、「夢につながる道に進めなくなった時、本当に自分が何をしたいのかを、心を覗き込むようにして、じっくり考えるようになる」、、、ならざるを得なくなり、真剣に選択肢を選ぶことになるので、良い選択肢を選べるのだ、と著者はまとめる。

結果論かも知れないが、みんな、思い通りにいってる訳ではないと元気付けてくれる。卒業研究テーマ決めから、研究者になるまでの一人の人生を味わえる一冊。

もくじ
1.もう一つの社会—ミツバチコロニーの概要
2.巣仲間認識—まとまりを保つしくみ
3.フィリピンへ行ってきます
4.ミツバチの遺産相続問題
5.蜂の社会を作りだす脳内物質
6.バッタとケブカ
7.ダンスコミュニケーションと採餌
8.ミツバチの燃料調節

2018年11月26日月曜日

衝撃的なタイム

午前
・DNA抽出
・PCR実験
・ゼミ

午後
・会議
・授業準備
・電気泳動
・PCR実験

朝早く来て実験したのに、、、全くバンドが見られず。

久しぶりにライブで競馬を見ていたが、昨日のJCは、2:20:06、という衝撃的なタイムだった。

ダービーで2:23台が出るようになって、随分と速くなったと思っていたが、あまりにも速すぎる、、、高速馬場問題が再燃するかな?

怪我せずに、来年も活躍してくれることを祈る。

関東対抗戦は、早稲田が慶応に勝った。帝京大を物差しにすると、慶応有利かなと思っていたが。

早明戦は、さらに別物。優勝をかけた面白い試合になりそうだ。

2018年11月20日火曜日

やっと発表

午前
・電気泳動
・PCR実験
・メール書き

午後
・学会発表準備
・卒論指導(データ整理)
・PCR実験
・学会発表準備

来週の土曜日に鳥取県生物学会で発表。最近、力を入れて調査しているマダニをやっと発表、、、卒業生が。

唐沢重考・本多正尚:鳥取県で見つかったサソリモドキの侵入経路の推定

柴田祥明・山内健生・唐沢重考:鳥取県東部の森林環境におけるマダニ相および宿主に関する知見について

虎狼の血」、はかなり面白かった。続編を作るようなことを聞いたけど、松坂桃李で作るのか?

50回目のファーストキス」は、前半の悪ふざけが多すぎな気がした。福田雄一がラブストーリーを作るとこうなるのか、、、と思ったけど、リメイクなのか。

記憶がなくなるのと、時間を超える映画を観るのは不安があるけど、十分、面白かった。前半がダラダラしたけど。

明日、福岡へ。

2018年11月19日月曜日

クモの写真

午前
・電気泳動
・ゼミ
・卒論指導兼電気泳動

午後
・会議
・PCR産物の精製
・会議
・PCR実験

バタバタした一日だった。

昨日の鉄腕ダッシュに、福原先生のクモの写真が使われていた。

今週、会う機会があるので、どのような経緯があったのか聞いてみようかと。

2018年11月18日日曜日

群雄割拠

とうとう明治が帝京を倒した、、、。

明治がスクラムで圧倒した姿に感動。

帝京の独走が終わって、本格的な群雄割拠の時代になったかな。

2018年11月16日金曜日

2回連続

午前
・データ整理
・卒論指導兼電気泳動

午後
・ゼミ
・卒論指導兼PCR実験
・卒論指導兼電気泳動

一日中、学生と一緒にいた感覚。

2回連続でネガコンが増えた。どうやらプライマーに問題がありそう。

2018年11月15日木曜日

捕まえたことのない

午前
・電気泳動
・PCR産物精製

午後
・会議
・卒論指導兼PCR実験
・シーケンス準備

貴重なサソリモドキを頂いた。自分では捕まえたことのない個体群。

2018年11月14日水曜日

+α

午前
・共同研究相談

午後
・電気泳動
・卒論指導
・PCR実験

12月1日(土)に開催される鳥取県生物学会で、卒業生が発表を行う予定。卒論発表+αだが、そのαは私が担当。

ということで、切羽詰まって実験を進めているが、ギリギリになりそう。

2018年11月13日火曜日

緑膿菌

午前
・修論論文化
・卒論指導

午後
・授業準備
・授業
・PCR実験

倉吉市で行われていたクライミングのアジア選手権は、土曜日の午後、リード男子決勝の観戦に行けた。

会場設営のために選手も含めて会場の外に出るため、会場周辺を選手が普通に歩いているのが印象的だった。有名人をたくさん生で観ることができた。

その後、喉の激痛に襲われ、人混みで風邪をひいたかと、、、病院にいったら風邪ではないだろう、、、と。薬を飲んだら治ってきたので安心。

しかし、その病院で、正月にすっぽかした耳の検査結果を知らされたが、緑膿菌が繁殖していたらしい。

そして、昨夜は新歓でした。

2018年11月9日金曜日

探偵ナイトスクープ

午前
・DNA抽出
・授業準備

午後
・ゼミ
・卒論指導
・授業準備

本日の探偵ナイトスクープは青色ダンゴムシだそうで。

2018年11月5日月曜日

コウヨウザン

午前
・シークエンス結果整理

午後
・標本整理
・シークエンス準備

週末の学会は、あまり自分には関係ない分野なので期待していなかったが、色々と勉強になった。

公開シンポジウムでは、コウヨウザン、という植物を取り上げた。中国原産のスギの仲間で、日本のスギやヒノキに比べて成長が早く、林業への利用が期待されているそうだ。

「杉」は、日本のスギではなく、「コウヨウザン」を指すらしい。

また、研究発表は、林業への応用利用に関するものが多く、普段の観点とは違って良い刺激になった。

出発日は、鳥取周辺は結構な雨だったのだが、抜けた綺麗な虹がみられた。

2018年10月31日水曜日

日本シリーズで盛り上がる

午前
・PCR実験
・標本整理

午後
・標本整理
・電気泳動
・DNA抽出

青色ワラジムシ類を送って頂いた。サンプル・情報の提供はとてもありがたい。


3地点のサンプルだが、1地点で3種含まれている場所もあった。塩基配列のデータから種間を超えて感染すると考えられている。

週末は日本シリーズで盛り上がる広島で学会。発表はせず実行委員として参加。

ついでに採集も!

2018年10月30日火曜日

時間オーバー

午前
・PCR実験
・標本整理

午後
・書類書き
・研究室の片付け
・授業
・電気泳動

18:00終了の授業、、、2回連続で時間オーバー。次回こそはキッチリ終わりたい。

電気泳動の結果は、かなり悪い。薄くは増えているサンプルもありそうなので、2段階PCRを試してみるか。

2018年10月29日月曜日

感動

午前
・DNA抽出実験
・ゼミ

午後
・卒論指導
・DNA抽出実験
・授業準備

行ってQでルワンダのゴリラを観に行ってたのを観て、これを思い出した

そして、先週の行ってQのエンディングロールに卒業生の名前を見つけて感動、、、。

オールブラックスvsワラビーズは、やはり面白かった。脳震盪で苦しんでいたベン・スミスがトライしたのを観て感動、、、。

2018年10月26日金曜日

力つきた

午前
・標本整理

午後
・ゼミ
・卒論指導
・標本整理

古い標本の整理に伴いデータ入力を進めると、色々と問題が見つかる。

ワラジムシ類の研究を始めた頃の中途半端な整理が、今となっては非常にわかりにくい。3000標本分のデータを見直したところで力つきた。

2018年10月25日木曜日

イチイ

午前
・標本整理
・学会業務

午後
・標本整理
・会議
・卒論指導
・標本整理
・学会業務

2015年の沖縄島、奄美大島調査の標本の一部がナゼか種同定されていなかったことが判明した。

新しい論文に必要なので、久しぶりに種同定。

船通山は植生が良い状態で残っており、頂上付近にはイチイが群生しており、天然記念物に指定されている。

2018年10月24日水曜日

天叢雲剣

午前
午後
・野外調査

船通山へ。

ヤマタノオロチが住んでいたという伝説がある山。

ヤマタノオロチはスサノオノミコトによって切られるのだが、その際に、天叢雲剣ができたという。

この剣は、天照大御神に献上され、のちに三種の神器となる。

頂上にその碑がある。


ワンピースの今後の展開次第では、人気が出るのでは、、、と期待。

鳥取県のほぼ端から端に移動した。

新ネタの良い調査地を見つけられたが、ワラジムシ類はいまいちだった。

2018年10月23日火曜日

光が

午前
・標本整理
・授業準備

午後
・卒論指導
・授業
・シーケンス結果整理

久しぶりの専門の授業。ペース配分はギリギリセーフ、、、ややオーバー。

どうしても増えない系統があり、昨年から悩まされてきたサンプルの系統解析。少しだけ光が見えてきた。

2018年10月22日月曜日

何も

午前
・標本整理
・統計ゼミ

午後
・会議
・講習会
・授業準備

今日は何もできずに終わった。

2018年10月19日金曜日

もう一回

午前
・PCR実験
・授業準備

午後
・ゼミ
・実験指導
・電気泳動
・学会業務

TemplateDNA濃度が、かなり少ないと思われるサンプルのPCR。


どうにか増えてはいるが。一応、もう一回やっておくか。

2018年10月12日金曜日

ミス

午前
・学会業務
・書類書き

午後
・ゼミ
・面談
・書類書き
・DNA抽出

焦りのせいか、色々とミスが多かった。結局、締切間近×2を片付けることができず、、、。

2018年10月11日木曜日

週末勝負

午前
・授業の準備
・授業準備

午後
・会議
・標本整理
・書類書き

色々と締め切りが迫って来た。来週は出張、、、週末勝負か。

2018年10月10日水曜日

ダンゴムシの模型

午前
・PCR実験
・シーケンス結果整理
・授業準備

午後
・電気泳動
・授業準備

シーケンス結果が届いたので、少しだけ整理。ナカナカ良い成績。この領域の後ろにつく予定のプライマーでPCRを試す、、、が全く増えず。

新しくプライマーを作成した方が早そう。

別の研究室の卒業生が、調査のついでに研究室に訪問してくれた。

何となく好きかと思って、、、とダンゴムシの模型をくれた。ダンゴムシの研究をしていることを知らなかったらしい。


大人気で入手困難とのこと。

2018年10月9日火曜日

相応しい

午前
・学会業務

午後
・学会業務
・書類書き
・面談
・DNA抽出

WBSSはすごい瞬間を観てしまった。スポーツの歴史に残るできごとだった。

そのあとのマラソンも凄かった、、、凱旋門賞は残念だったけど。

スポーツの秋に相応しい週末だった。

2018年10月5日金曜日

大学祭

午前
・DNA抽出
・書類書き

午後
・本読み
・面談
・書類書き

3連休は大学祭らしい。台風がどうなることか。

2018年10月4日木曜日

発生

午前
・PCR産物精製
・書類書き

午後
・書類書き
・授業の準備

授業が始まると、色々と新しい業務が発生する、、、どうにか1プレート+αをシーケンスへ。

2018年10月3日水曜日

条件

午前
・PCR実験
・書類書き

午後
・シーケンスデータ整理
・電気泳動
・書類書き

結構苦労させられたサンプル。どうにか条件は決まったかな?シーケンスも順調に言ってくれると良いけど、、、。

2018年10月2日火曜日

時間がかかる

午前
・書類書き
・授業の準備

午後
・授業の準備
・DNA抽出
・シーケンスデータ整理

新しい授業の準備は時間がかかる、、、。

WBSSはテレビ放送どうなるのだろう、と心配してが、フジテレビで放送されるそうで安心した。今週末か、、、凱旋門賞もある。

2018年10月1日月曜日

始まった

午前
・シーケンスデータ整理
・統計ゼミ

午後
・授業の準備
・授業
・書類書き

授業が始まった。本日は、ガイダンスで生態学面白ネタ特集。話す方は楽しかった、、、。

ゼミと授業の2コマ話しただけで、声の調子が悪くなった。

2018年9月28日金曜日

中間報告

午前
・卒論中間発表会

午後
・卒論中間発表会
・書類書き

一日中、卒論発表の中間報告を聞いて過ごした。疲れた。

2018年9月27日木曜日

お絵かき

午前
・授業の準備
・書類書き

午後
・記憶がない、、、
・会議
・書類書き

あまり捗らなかった1日。ダンゴムシのお絵かきを頑張った。

2018年9月26日水曜日

つもりだった

午前
・PCR実験
・中間発表練習

午後
・授業の準備
・電気泳動
・書類書き

今日は、実験をせずに書類書きと授業の準備に没頭する、つもりだったが、やはり実験をしたくなってしまった。

シーケンスデータも返ってきたが、面白い結果と全く読めていないサンプルが混在。とはいえ、実験条件が大体決まってきたのは良かった。

2018年9月25日火曜日

青色ワラジムシ類の情報

午前
・PCR実験
・授業の準備

午後
・大学業務
・電気泳動兼卒論指導
・中間発表練習

予定通りに進まなかった1日。

ただ、なかなか綺麗に増えてくれなかったサンプルのPCRの目処がついたのは嬉しかった。

52℃。


54℃


Tm値の平均よりも少し高め。

青色ワラジムシ類の情報を頂いた。

2018年9月21日金曜日

目処

午前
・電気泳動
・PCR産物精製
・学会業務

午後
・PDF自炊
・シーケンス準備
・授業の準備

とりあえず、いくつかはシーケンスに出せそう。実験方法に目処がつけば良いけど、、、。


かなり期待して観たが、やはり面白かった。


オール・オア・ナッシング~ニュージーランド オールブラックスの変革~

オールブッラクスは、ただのラクビー代表チームではなく、常に勝つことが求められるどころか、圧勝することが求められる特殊なチームである。

怪我で戦列を離れる選手がいる一方で、チャンスをもらえる選手もいる。そして、結果を残せる選手と、プレッシャーに負ける選手もいる。オールブラックスの試合を見る楽しみが増幅されること間違いなし。

日本では、関東対抗戦が先週末から始まったが、今年は練習試合で帝京が何度か負けている。打倒帝京なるかな。

ラクビーW杯のチケット販売も始まった。申し込んでみるか。

2018年9月20日木曜日

安心

午前
・電気泳動
・バレー大会

午後
・会議
・PCR実験

詰め込んだ1日だった。

昨日、うまくいかなかったPCR、アニーリングを上げたら改善された。ひとまず安心。

2018年9月19日水曜日

ダメダメ

午前
・電気泳動
・卒論中間発表の練習

午後
・PCR実験
・文献探し

予備実験のサンプルではうまくいったPCR、研究用の標本でやったらダメダメだった。


重要なデータなのだが、、、。

2018年9月18日火曜日

スピード

午前
・DNA抽出
・論文書き
・文献探し

午後
・卒論指導
・PCR実験

今月末の卒論中間発表に向けて、卒論について真面目に考える。

一方で、論文書きはかなり停滞。間隔が空きすぎて、思い出すだけで時間がかかってしまう。

鳥取県倉吉市にあるクライミングセンター。ボルダリングだけでなく、リード、そして、スピードもできる。


ボルダリングとリードは自由にホールドを設置できるが、リードは世界共通の配置らしい。ということで、その基準を満たしている証明書が貼ってある。

2018年9月14日金曜日

15年

午前
・PCR実験
・データ整理

午後
・データ整理
・標本受け取り
・電気泳動
・DNA抽出

日曜日に鳥取を出発して名古屋まで行く予定だったのだが、大雨で鳥取から山陽に出る電車が全てストップ、、、。

どうにかこうにか名古屋へ到着した。

月曜日に日本昆虫学会で発表。

地下鉄の塩釜口が最寄り駅だったのだが、腹痛のため一つ手前の八事駅で下車。


しかし、この八事は、博士課程3年間を過ごした思い出の地でもある。

家賃9000円のオンボロアパートに住んでいたのだが、まだ残ってた!


15年ぶりぐらいか。懐かしかった。詳しくは覚えていないが、駅前は結構変わった印象。

本日は、初産地のサソリモドキと


ハナダカダンゴムシを頂いた。


DNA抽出をして終了。

2018年9月7日金曜日

端から端まで

午前
・会議視察

午後
・会議視察
・学会編集業務

県の会議の関係で、鳥取県の端から端まで移動した。

2018年9月6日木曜日

+30mL

午前
・学会編集業務
・卒論指導

午後
・卒論指導
・学会発表準備
・シーケンス準備
・DNA抽出

明日は一日中、県会議で県内をウロウロ。

週末から学会発表を経て出張へ。バタバタして出張すると大概何かを忘れるが、、、。

バタバタしながらDNA抽出。キアゲンキット、、、何かおかしい、、、エタノールの注入量が書いていない。


エタノールを入れない新製品なのか悩んだが、同時に買ったもう一つのキットを確認したら+30mLだった。

2018年9月5日水曜日

アオミオカタニシ

午前
・学会編集業務
・卒論指導

午後
・学会編集業務
・卒論指導

卒業研究でPCRと電気泳動について教える。バンドがとても薄かった。何が原因か、、、。

沖縄で見つけたアオミオカタニシ。原始的な種らしい。

2018年9月4日火曜日

ギャップ更新

午前
・シーケンス依頼
・学会編集業務

午後
・標本整理
・DNA抽出
・学会発表準備
・学会編集業務

台風は、瞬間的に強い雨が降ったが、そこまで酷い状況ではなかった?ずっと研究室に居たので分からないが。

卒論の予備実験で行なったシーケンス結果が戻ってきた。パッと見ではナカナカ良さそうな結果。

学会発表の準備は、核心部のスライドが完成。間に合いそうだ。


先日の沖縄調査では、以前設置した調査地に行く道が崩壊していた。


根から木が倒されていた。こうやってギャップ更新が起こる。

2018年9月3日月曜日

オール・オア・ナッシング

午前
・PCR実験
・書類書き
・学会発表準備

午後
・学会発表準備
・標本整理
・PCR産物精製
・学会編集業務

来週月曜日の昆虫学会の発表準備を始めた。新しいサンプルを加えて系統解析を行う。久しぶりなので心配したが、過去のメモがしっかり書かれていたのでスムーズに進んだ。

まずは色々書き込んだバージョンを作成。


卒論で学生が一度整理した標本の再整理。例年のことだけど、最初の頃はミスが多い。

コシビロにオレンジの斑模様が入る個体が多く含まれていた。


先日の沖縄調査の移動中に観ていた。


オール・オア・ナッシング

超おすすめ。面白い。

アメフトのルール(少なくともポジション)が分からないと面白さ半減かも知れないけど、チームスタッフとして参加している気持ちになれる。

他のチームもあるのか、、、オールブラックスもある!

しばらく楽しめそう。